8月8日-8月9日,中国第三届合成生物学创新赛在深圳举行颁奖仪式,我院胡升副教授、赵伟睿副教授指导的“怎么可能不队”与来自北京大学、上海交通大学、日本早稻田大学等全球60余所高校的147支队伍同台竞技,通过激烈比拼斩获银奖!
本届比赛由中国生物工程学会合成生物学分会指导并主办,由深圳理工大学合成生物学院、中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所、深圳合成生物学创新研究院、深圳市合成生物学协会共同承办。创新赛践行合成生物学“造物致知、造物致用”的理念,鼓励当代学生从兴趣出发,探索合成生物学在不同领域的创新和应用,同时为合成生物学、生命科学、交叉学科培养后备生力军。
大赛设立了“常规赛”“细菌博弈赛”和“蛋白设计赛”等3个赛道,我院“怎么可能不队”由生物工程213(求是)班和生物工程223(生物智造班)同学为主体参加了蛋白设计赛。根据比赛要求,参赛队伍要基于主办方提供的近15万种绿色荧光蛋白突变体的序列和荧光强度信息,采用人工智能方法构建序列-荧光强度预测模型,并设计出10条预测为高性能的突变体序列。
我院参赛同学们在两位老师的指导下,采用迁移学习算法构建了关联序列-荧光强度的端到端模型,并基于荧光蛋白结构-性能的先验知识进行了特征参数和学习模型的筛选,创造性地根据不同突变体的亲缘关系进行了不同学习模型的融合,显著提高了模型的预测准确性,模型性能较已有文献报道水平获得显著提高,从而最终脱颖而出,与来自北京大学、天津大学、中山大学等知名高校的12支队伍共同获得银奖。
这也是我院首次组织参加该项赛事,同学们从4月开始备赛,“不枉付出,学到了很多。”团队同学们表示通过此次比赛,对专业的认识和理解更加深入了,兴趣也更浓了。
△获奖团队师生合影(前排左起:叶恒玲、孙驰洲、张微、朱杭波、郑欣瑜、姜蕾,后排左起:赵伟睿、杨开、王世成,胡升)